El mercado de Portugalete se edificó gracias a una cesión de terrenos del Cabildo, justamente en el espacio que Herrera había destinado para el claustro de la Catedral, y fue inaugurado en 1881 siguiendo más o menos el diseño original del arquitecto municipal Joaquín Ruiz Sierra a quien el Ayuntamiento había encargado el proyecto en 1877.
Felipe II encargó a Juan de Herrera los planos de un enorme templo que nunca llegaría a terminarse. Sobre las ruinas de la Colegiata que se había comenzado en tiempos del emperador Carlos I para sustituir a la edificada por el Conde Ansúrez, se iniciaron las obras en las que intervinieron sucesivamente distintos arquitectos.
